基于分子模拟筛选新的VEGFR-2抑制剂的研究.docx

摘要：木文生耍研究血管内皮生长因子受体-2的天然产物抑制剂。通过DS中的基于受体产生药效团的方法，结合CDOCKER,对天然产物数据库(NPBL)和天然产物类似物数据库(NPLL)进行筛选，得到了7种新的VEGFR-2的天然产物抑制剂。药效团模型(Pharmacophore)：是指药物活性分子中对活性起着重要作用的“药效特征元素”及其空间排列形式，可以认为是大量活性化合物共同的成药特征。基于药效团模型，科研人员可以进行快速的药物虚拟筛选工作，寻找结构新颖的活性分子；也可以解释化合物的构效关系，进行化合物的结构优化与改造；此外，还可以进行化合物靶标的识别，实现反向找靶c Discovery Studio中的Catalyst模块，是经典的药效团模型生成、验证及虚拟筛选的工具，可以基于配体、受体以及复合物结构进行定量、定性的药效团模型研究。分子对接(moleculardocking)是基于结构药物设计的核心模拟手段，依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程，模拟受体配体相互作用，预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。采用分子对接模拟技术，科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选，药物分子的结构改造，药靶相互作用的机理研究等工作，从而大大提高实验效率。在DiscoveryStudio这一分子模拟的综合平台中，共有四种对接程序，包含Libdock. CDOCKER.FlexibleDocking,这二种对接算法各有优势，能够满足广大科研工作者的多种应用需求,为其提供配体受体间相互识别的“利器”。基于分子模拟筛选新的VEGFR-2抑制剂的研究ref： Cells 2019, 8, 269 ; IF=4.829链接：doi:10.3390/cells80302691仙管生成被定义为新伽管的形成，是许多癌症中表现出来的一种关键现象。血管内皮生长因子受体-2 (VEGFR-2)在肿瘤血管生成过程中起着关键作用，虽然FDA已经批准了很多VEGFR相关的药物，但是研究发现肿瘤细胞表现出很电的耐药性，这就迫切需要发现新的针对信号通路的抗血管生成抑制剂。天然产物在抗肿瘤方面发挥着越来越重要的作用，同时因其安全性高的特点而得到广泛应用。本文通过DS中的基于受体产生药效团的方法，结合CDOCKER,对天然产物数据库(NPBL)和天然产物类似物数据库(NPLL)进行筛选，得到了 7种新的VEGFR-2的天然产物抑制剂。图一基于受体产生的药效团模型。2136图二对照分子以及筛选出的分子与受体的相互作用模式。MaXFlow生物医药智能创新平台，由创腾科技自主研发，旨为不同领域的一线创新科技工作者提供一个合作共享的B-S架构平台。以“数据自由，模型自由”为理念,在结构模型与预测模型进行融合的基础上，实现模拟与AI需求的合并，为研发赋能。