Analyst software软件操作指南中文教程--2A-1Tutorial for Manual MS_MS.docx
IIA.Manua1MS-MSSetupandAcquisition教程本教程描述如何在manua1tunewindow下setup和进行Product,PrecursorandNeutra11ose扫描实验。使用4个化合物混合物(有一个共同碎片离子)溶液(1m1,1ng1),也可自行选择化合物配置。1. Q1Sing1eMSExperiment(Q1全扫描):点击T左边的hourg1assicon(standby)使仪器在standby状态，点击HardwareConfiguration,激活MassSpecOn1yo先点击T»再点击navigationbar下的manua1-tuning。激活(开动)装有化合物的syringepump(101min)(API3000,手动、API2000通过syringepumpdropdownmenu控制).从scantypemenu中选择Q1scan。Gassettings推荐以下值:NebZGas1-8(API30(M)or25(API2000),turboGas2-off,Tcmp-off,andIS-defau1t(>输入massrange(能包括化合物分子离子峰)和scantime：5secondo进入advancedMStab,andse1ectfastprofi1eforstepof.2andse1ectMCAoInputaDPof40andaFPof250underthecompoundheader检查和调整离子源的位置(参见SeCtion1-2)o点击ACg“ire进行Q1experiment。(Toobtainoptima1va1ues,manua1tuningisrequiredofa11compounddependentparameters.)下谱图中四个化合物的分子离子分别为M/Z251.2,265.0,279.2and311.2«进行子离子扫描，寻找某一个共同碎片离子。2. ProductIonScan（子离子扫描）：Save当前acquisitionmethod为'genericQ1infusion在scantype下选择ProductIon。检查离子源条件（与Q1扫描同），Ana1yst以defau1tva1ue开CADgas。设定DP,FP（与Q1扫描同）。输入其中一个母离子在PrOd11CtSOf框中如311.2mz,然后设定massrange从40amu到比母离子大10amu（单电荷离子）如325m/z。在Advancedtab中设置参数（如Q1experiments）o进入reso1utiontab选择1owreso1utionforQ1o（此设置会增加灵敏度和有正常同位素分布）。设置CyCIeS（SCanS）为20然后点击SIart,调节CO1IiSionenergy（CE）以便产生好的碎片离子分布，CE能量过高，会产生很多小碎片（信息过多过杂）；而CE能量过低，会产生大碎片和母离子（信息过少）,然后打印报告。打印此谱作为参考，并进行第二个母离子的打碎实验。在采集数据过程中，试验变化CE值,并打印报告，看谱图有何不同。在子离子扫描优化CE过程中的第二种方法采用RamPParameter优化。方法是：在同一窗口中点击EditRamP并选择Co"sE?输入范围从25（开始）至J61（停止）SteP为2。当rampParameter被激活后，scans/cyc1es数等于range除以step,本例中有18scans进行增加CE实验。点击C）K,注意：应出现rampparametercheck。点击Acquire开始采集数据。根据此方法，变化range和SteP得到一个很好的productionSPeCtrUm。记住:低CE易产生大碎片离子和母离子，而高CE易产生小碎片离子（有时对于某些化合物，很高的CE会产生很差的谱）。4. PrecursorIonScanning（母离子扫描）：下一步，设定一个强度高的共同碎片（子离子）的母离子。从SCantyPemenU中选择PreCs"Ion,保持所有sourceandgasParameterS与前面实验相同。从手动调节CE的子离子扫描谱中选择能产生好的共同碎片的CE值。子离子扫描可以MCA方式重复来确定最好的CE值。在rampparameterbox中去掉"选勾"并输入所需的CE值。输入碎片M/Z并选择能包括所有Q1可能母离子的质量范围，设定QI为Unit分辨率、Q3为IoW分辨率。点击AC4Oe采集数据。母离子扫描实验会显示一个图谱，包含能产生所选的碎片离子的所有母离子。该实验非常有用，特别对于亚杂体系的代谢产物的化合物结构鉴定是一个强有力的工具。5. Neutra11ossExperiment（中性丢失扫描）：（AdVaiICed）中性丢失常用来寻找能失去一个共同的中性碎片的带电荷碎片离子，比较常见的如失去一个COz或其它不带电荷的碎片。对本实验中的这些化合物而言，共同的中性碎片是155,用同一样品进行手动CEproductionexperiment采集最强的谱。下图显示的子离子扫描，156.2fragment最强（CE为30时谱最优）。转换至IJneutra11ossexperiment,输入优化的CEva1ue,设定reso1utionprecursorexperiment中所述。输入1ossOf155.0.点击Acquire采集数据。E>10EdIAcqurvJooh&M3dip由G#0S：41UyM"3Oa.arrok"31XE"p丛从星一*WaiUgoT*公4人，0Cor6gre，S0VCtaigurefton田Xa0*aroCogeret)On/PWpofiUdeteEdMaTse0)/用WMOPtmMbonArrtiefrv0ptfmra6o|力MenuaiTuNngPAojw>QuidAtq,atonMotiod,0uWAcqwon>>E>xwvew卜E0g个OpenDataAteS0pf*CompoundDebate*匕OuarmatoyGjtfmooonVMzafd09，8F¼JtTeMeAcquroEdtftampJ如但S1opSymg。PmpScUfCt/GasCONBMReso1j1nnDetector|D3nPctertia1(DP)FoCUJr冷PCteMM夕P)Er<uncePOtMiH吁)C叫FEwg,(CE)AnnceJMSGPWtv1OWorP'e<iodDweion8"oWdM)CyCte1Scaf>poNoud1o«jScajJ.1.Ffc.F1IStart¾40oWWordToH4AoIyUrTUgM=4W×AM上图包括所有能产生155中性碎片的母离子。6. Tuning:一个完整的manua1或autotune,对于相近的化合物的优化值如DP,FP,EP,CEP,CE和CXP(API2000)或DP,FP,CE和CXP(API3000)会大大提高灵敏度。如需详细信息，请查阅Tune和AcquireTutoria1或theManua1TuneTutoria1或仪器操作手册。
