SARS-CoV-2 全基因组 T 细胞表位作图揭示COVID-19 患者的免疫优势和大量 CD8 + T 细胞活化.docx
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1、SARS-CoV-2全基因组T细胞表位作图揭示COVID/9患者的免疫优势和大量CD8+T细胞活化绘制SARS-CoV-2T细胞识别图由细胞毒性CD8+T细胞介导的细胞免疫有助于防止病毒感染,但对SARS-CoV-2T细胞的全谱识别和先前存在的T细胞免疫的作用仍未完全了解。塞尼等人。使用DNA条形码肽-MHC-I多聚体扫描SARS-CoV-2基因组,以识别C0VID-19患者的CD8-细胞。在10个分析的HLA分子中,122个独特的SARS-CoV-2CD8检测到T细胞表位,包括5个主要集中在0RF1内的免疫显性表位。健康供体表现出对较低亲和力的广泛T细胞识别,并且共享表位可能部分归因于与季节
2、性人类冠状病毒的同源性。与轻度疾病相比,严重疾病期间SARS-CoV-2特异性CD8的频率和活化增加,突出了与疾病进展相关的T细胞反应的差异。抽象的T细胞对于有效清除病毒、消除病毒感染细胞和长期疾病保护很重要。为了检查C0VID-19中CD8T细胞免疫的全谱,我们通过实验评估了3141种主要组织相容性复合物(MHC)I类结合肽,覆盖了完整的SARS-CoV-2基因组。使用DNA条形码肽-MHC复合多聚体结合T细胞表型面板,我们报告了122个免疫原性和免疫显性SARS-CoV-2T细胞表位子集的完整列表。在C0VID-19患者中观察到大量CD8-细胞识卧高达27%的cd8+淋巴细胞与saRS-C
3、oV-2衍生的表位相互作用。大多数免疫原性区域来自开放阅读框1(0RF1)和0RF3,其中0RF1包含大部分免疫显性表位。在健康供体中也观察到对SARS-CoV-2衍生表位的低亲和力CD8-细胞识别。这种预先存在的T细胞识别特征与在C0VID-19患者中观察到的表位景观部分重叠,并可能推动T细胞对SARS-CoV-2感染的反应进一步扩大。SARS-CoV-2特异性CD8+的表型T细胞在C0VID-19患者中显示出强烈的T细胞活化,而在健康个体中观察到最小的T细胞活化。我们发现,与轻度疾病患者相比,重症患者表现出明显更大的SARS-CoV-2特异性T细胞群,并且这些T细胞表现出强大的激活特征。这
4、些结果进一步加深了我们对T细胞对SARS-CoV-2感染的免疫力的理解,并假设强烈的抗原特异性T细胞反应与不同的疾病结果相关。介绍由高度传染性的SARS-CoV-2(严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2)引起的C0VID-19(冠状病毒病2019)大流行以前所未有的规模挑战了公共卫生,迄今已导致全球超过200万人死亡(7)oT细胞在控制和消除病毒感染方面发挥重要作用;CD8+T细胞对于有效清除病毒感染细胞至关重要,而CD4,T细胞对于支持CD8+T细胞反应和B细胞介导的特异性抗体产生都很重要。持续大流行的特征表明,T细胞识别对于介导针对SARS-CoV-2的长期保护至关重要(2,因为抗体介导的反应
5、似乎在恢复期患者的后续评估中下降,尽管目前尚不清楚这如何影响再感染的风险以及疾病保护所需的抗体水平(3-52。此外,对密切相关的SARS-CoV感染的研究表明,即使在SARS康复患者中11年后没有B细胞反应(6,7CD8+记忆T细胞在长期记忆中的潜在作用也是如此。对冠状病毒的长期保护。最近的几项研究报告了SARS-CoV-2感染患者的强大T细胞免疫(8-102_一未暴露的健康个体也表现出仅限于SARS-CoV-2的功能性T细胞反应性,9厂11-15人据推测,观察到的T细胞交叉反应源于常规暴露于广泛传播的普通感冒冠状病毒人类冠状病毒(HCoV)(HCoV-0C43、HCoV-HKUKHCoV-N
6、L63和HCoV-229E),其中90%的人群对这些病毒呈血清反应阳性(16,互)并且与SARS-CoV-2基因组具有实质性序列同源性(18,19_T)。然而,人们对这种预先存在的免疫对与C0VID-19疾病相关的T细胞识别的影响知之甚少。SARS-CoV-2感染可导致轻度至重度疾病(包括死亡),但也描述了大量无症状感染者(四-驾)。以交叉反应性T细胞为代表的预先存在的T细胞免疫的存在可能对个体对SARS-CoV-2感染的反应产生重大影响。然而,它们在遇到SARS-CoV-2感染时的生物学作用仍不清楚,它们对疾病保护的贡献需要确定。此外,在严重的临床疾病中,报告了细胞因子释放综合征,在某些情况
7、下,可能会通过免疫抑制药物或抗白细胞介素6(IL-6)抗体治疗来抑制(义,义)。这种临床特征表明潜在的不受控制的免疫反应与强T细胞活化有关。CD8+T细胞通过T细胞受体(TCR)与病毒感染细胞表面上主要组织相容性复合物I类(MHC-1)分子呈递的肽抗原之间的特异性相互作用而被激活。尽管在C0VID-19和先前存在的T细胞的背景下都报道了SARS-CoV-2特异性免疫,但病毒基因组内的全谱精确抗原(最小肽表位)与这种免疫及其在SARS中的免疫优势相关-CoV-2感染的患者,未完全描述。使用我们基于DNA条形码肽-MHC(PMHC)多聚体(25)的大规模T细胞检测技术,我们在整个SARS-CoV-
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