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1、XX医院科研大数据平台建设项目采购需求一、项目背景及建设目标医院经过多年运行,积累了大量的临床资料数据,对于这些繁多零碎的数据 资料,传统的手工方式进行统计检索繁琐费时,代价昂贵,效率低下,而且容易 造成部分数据丢失,甚至产生错误数据。临床科研实践中需要一种简便、快捷、 高效的方法来对数据资料进行储存、整理,并从中分析、提取有用的信息指导临 床决策。当前大数据、云计算等新兴信息技术的迅猛发展为该问题的解决提供了 机会和可能。医院信息互联互通标准化成熟度测评方案等文件中也明确要求 破除信息壁垒,促进数据共享互认,加强智慧医院建设,推动人工智能、等新技 术应用。本项目是在XX医院开展临床科研建设与
2、医学智能服务建设,在临床数据集 成、自然语言处理、深度学习等多方面协助临床研究人员,使得临床人员在数据 获取、数据挖掘、临床转化等多方面得到全面的提升。从而有力提升临床数据科 学和临床研究的水平,通过人工智能解决医疗问题、临床研究和工作中遇到的“痛 点”,改善疾病的检测、诊断、治疗和预后管理,最终提高患者满意度。通过建设临床专科专病数据库使之具有:支持疾病相关的数据模型创建能力; 快速集成多样数据源的能力;支持数据增量更新的能力;强力的预测分析能力; 语义的文本挖掘能力。打通各业务系统之间的壁垒、建立数据标准体系,“唤醒” 医院“沉睡”多年的宝贵临床数据,充分发挥数据的整合利用价值。并以此为基
3、 础,在科研创新方面,有针对性地进行大样本做临床回顾性研究,及时将国内外 临床科研成果转化为临床应用。通过建立病例大数据处理和“互联网+”技术建立临床多中心科研EDC系统, 开展创新的临床前瞻性研究,有效利用医院系统积累的大量宝贵的病例数据和院 外病人康复和预后结局的数据,大幅度促进临床科研和患者健康服务的发展,改 变过去以“单打独斗”为主的科研方式,朝着以区域性医疗机构为主体、以网络 为依托,以聚焦慢性并、多发病、重大疾病,搭建高水平的临床医学研究平台。此次项目建设以临床科研难点为驱动,以需求为导向,充分发挥XX医院的 专业优势,搭建一个适合专科临床研究需要的系统化、规模化、集成化的研究平
4、台,结合临床科研成果,集成创新,促进学科、专科建设发展,确保稳定的发展 方向。结合临床科研需求,建设科研数据库,充分利用XX医院丰富的患者数据资 源,提升在医疗质控、临床科研和教学等方面的综合能力,推动重点临床学科发 展。通过接入特定疾病患者诊疗、治疗数据,并根据该疾病发生发展规律、诊疗 规律,进行疾病数据模型构建以及针对性的数据清洗、标准化、归一化、后结构 化处理,形成统一规范的专病科研数据仓库。在此基础上构建临床科室需的所科 研高级应用功能,应用可通过权限配置支持全院科研人员使用,并结合课题需要 进行CRF表单设计用于临床数据采集,用于循证医学上的大样本量临床科学研究, 提高临床科研生产力
5、。同时,在数据数据采集与处理的过程中,根据课题的要求 整合科研课题研究所需的临床病例数据。提供临床科研课题所需要的医学智能服 务,内容包括课题方案设计咨询、数据采集、数据清洗处理、统计报告输出。二、建设原则(1)整体性原则从医院的现实需求出发,统一规划、统一设计。临床科研数据库架构采用整 体化的设计理念,可以覆盖业务系统数据的完整接入,并可进行逐一数据的校验 服务以及对历史数据的关联性存储、数据利用、应用开发。可按需扩展和支撑第 三方应用系统的数据利用,覆盖每个系统。(2)支持原有业务信息系统充分发挥已有系统的功能,利用现有的数据库,通过临床科研数据库提供数 据集成和业务价值的增值。不仅能够保
6、存业务系统的原有历史数据,而且能满足 接入和管理现有及未来的数据增长的需求。(3)安全性具备全面的安全性设计,防止对数据的非法访问、破坏和泄露,如权限分级 管理、查询系统操作日志监控、修改留痕管理等。同时应能够提供对数据保护, 确保数据的完整性、保密性、不可抵赖性、一致性、可追溯性。由于临床科研数 据库将管理医院相关患者数据,系统架构须提供严格、严谨和完善的安全和隐私 管理策略和服务。(4)标准化临床科研数据库建设基于医疗行业标准,并支持面向SOA服务架构建设。所 采用的医疗行业标准具备国际领先性,并与医院实际数据情况相结合,建立医院 标准化的数据管理规范,提供相应的标准化组件功能实现标准化管
7、理服务(比如 数据标准化、术语服务等功能),这将节约持续发展的成本,简化持续发展的复 杂性,使得复杂的医疗数据管理和整合成本降低、改善数据整体利用效果。(5)扩展性系统架构要求不仅可以满足目前科研的数据利用需要,而且需要为将来新的 数据利用需求提供开放性。医疗科研的需求是随着时间的不断变化而动态改变, 因此系统整体架构需要提供针对不同业务领域的可扩展性功能,不能单单仅满足 目前需求,更需要满足未来新业务信息系统的接入。(6)高效性具备高性能大密度的计算、存储、并发处理和屯渡能力。系统性能响应时间 合理,完全满足业务需要,数据查询和分析和业务处理要求速度快、反应及时。 需要保证系统的稳定可用性。
8、(7)灵活性平台应采用模块化的设计,应满足目前医院的业务实际需求,也能充分考虑 将来业务种类增长后的需求。便于医疗服务业务的变化和扩展,提供丰富的开发 环境,支持多种应用的开发,能够实现跨平台数据库间的数据管理,具体良好的 第三方软件支持功能,提供用户应用层的组件支持,如配置数据接入工具满足业 务系统的更换需求,让用户可以自行使用配置工具进行数据接入。总之,临床科研数据库设计与建设应充分考虑整合和利用现有各种资源,既 要考虑平台的先进性和有效性,又要考虑其实现的可行性和经济性。平台的设计 与建设要符合业务需求,平台结构、数据接口应可灵活扩展,为将来平台拓展提 供空间。三、采购清单项目采用整体规
9、划,分步建设的模式,本次为一期项目,建设内容清单如下:序号系统模块功能描述建设内容数量单位1科研大数据中心基于医院临床科研建设要求, 在遵循相关标准与规范的基础 上,对临床诊疗信息(含历史 上积累的数十年信息及增量信 息),进行采集,以患者为中心, 对数据进行融合、治理、存储 与共享,构建湖仓一体化、支 持超融合及准实时数据入库与 分析的科研大数据中心,支持 与医院信息信息平台互联互 通,支持院内诊疗数据与患者 随访数据融合,支撑全院临床 科研粗粒度的数据检索需求。在院方应用需求及各信息化系统 端口配合支持下,完成项目入场前 近15年历史数据接入(包括门诊、 住院、妇幼保健电子健康系统数 据、
10、妇幼健康信息系统导入,数据 源包括如:HIS、EMR、手麻、重 症、放疗、输血、护理、病案、LIS、 RISs超声、内镜、病理、心电等 业务系统);以患者为中心,对历 次就诊数据进行集成、融合与清 洗;对患者隐私数据进行脱敏处 理;对入院记录、出入记录、既往 史、个人史、家族史、体格检检等1套信息进行段落拆分存储,并对重点 指标进行后结构化提取,完成现用 系统数据的初步治理;满足通过互联互通五乙评级相关 要求;平台架构设计应预留增量数据自 动接入接口,增量数据接入频率按 照院方需求进行配置,如每天更新 一次,每周更新一次(一期项目不 包括增量数据接入模块)。2大数搜索平台基于科研大数据中心,采
11、用跟 医学临床紧密结合的中文分词 技术,使得对非结构化文本的 分词,既快速又符合医学实际。 以智能全文搜索引擎为核心, 并在此基础上结合临床医学实 际进行二次开发,支持用户在 进行段落定位后进行全文搜 索;在保证快速搜索、支持全 文搜索的同时,搜索结果更精 确。同时,该全文搜索的结果, 也可以作为多维度病例挖掘的 手段之一。完成系统部署;实现统一身份认证;满足通过互联互通五乙评级相关要求;完成系统培训与上线实现全院推 广应用。1套3重点学科专病库基于科研大数据平台构建重点 专病数据库,基于疾病的发生 发展规律及诊疗规律,梳理专 病术语规范,构建专病数据模 型及质控规范,对数据进行深 度挖掘、细
12、粒度处理。基于可 视化科研数据应用平台,实现 一站式专病科研,包括队列创 建、指标提取、探索分析等。可方便临床研究者高效地进行 复杂队列发现,可根据研究课 题的要求导出需要的数据格 式,支持多维度数据搜索,满 足各种复杂条件联合检索功 能,从而实现研究队列人群的 快速发现及特征值的导出。完成1套专科专病数据库建设(医 院任选1个优势学科建设专科专病 库,将在本专科有门诊、住院记录 的所有患者的诊疗信息全部接入 数据库。以疾病发生发展规律和诊 疗规律为导向,构建专病术语集, 并以此为依据进行专病数据深度 治理,包括数据标准化、后结构化、 归一化等。支撑以具体课题研究方 向为导向的研究队列的构建及
13、一 站式数据探索分析);完成1套专病库系统培训;完成1套专病库正式上线应用;完成1个研究队列的创建、指标提 取、统计报告输出; 实现统一身份认证;满足通过互联互通五乙评级相关 要求。1套4单中心科研系统以临床研究课题或病种为导 向,基于多终端管理工具(PC 端、医生APP端、患者APP 端)收集临床研究所需的回顾 性、前瞻性数据,支持单中心 临床研究的开展,实现对临床 研究流程、方案及数据管理。 支持对人群基于预定义的规则 进行分组,支持对筛选出的研 究人群进行个性化随访、支持 满足条件的新病人自动入组,完成系统部署;完成系统与科研数据中心数据共享,实现表单智能化自动填充;完成一个示例科研项目
14、基础参数配置;完成一套示例科研随访表单制作;实现统一身份认证;满足通过互联互通五乙评级相关要求;完成系统培训。1套支持随访表单自定义设计,支 持与科研大数据平台数据融 合,实现院内外数据统一管理 与综合应用。5回顾性医 学统计分 析服务提供协助制定研究方案、数据 提取、数据分析、统计分析、 统计结果输出等服务。至少提供1个。1个四、具体系统总体功能1、科研大数据中心基于医院临床科研建设要求,在遵循相关标准与规范的基础上,对临床诊疗 信息(含历史上积累的数十年信息及增量信息),进行采集,以患者为中心,对 数据进行融合、治理、存储与共享,构建湖仓一体化、支持超融合及准实时数据 入库与分析的科研大数
15、据中心,支持与医院信息信息平台互联互通,支持院内诊 疗数据与患者随访数据融合,支撑全院临床科研粗粒度的数据检索需求。2、大数搜索平台基于科研大数据中心,采用跟医学临床紧密结合的中文分词技术,使得对非 结构化文本的分词,既快速又符合医学实际。以智能全文搜索引擎为核心,并在 此基础上结合临床医学实际进行二次开发,支持用户在进行段落定位后进行全文 搜索;在保证快速搜索、支持全文搜索的同时,搜索结果更精确。同时,该全文 搜索的结果,也可以作为多维度病例挖掘的手段之一。3、重点学科专病库基于科研大数据平台构建重点专病数据库,基于疾病的发生发展规律及诊疗 规律,梳理专病术语规范,构建专病数据模型及质控规范,对数据进行深度挖掘、 细粒度处理。基于可视化科研数据应用平台,实现一站式专病科研,包括队列创 建、指标提取、探索分析等。可方便临床研究者高效地进行复杂队列发现,可根 据研究课题的要求导出需要的数据格式,支持多维度数据搜索,满足各种复杂条 件联合检索功能,从而实现研究队列人群的快速发现及特征值的导出。4、单中心科研系统以临床研究课题或病种为导向,基于多终端管理工具(PC端、医生APP端、 患者APP端)收集临床研究所需的回顾性、前瞻性数据,支持单中心临床研究的 开展,实现对临床研究流程、方案及数据管理。支持对人群基于预定义的规则进 行分组,支持对筛选出