基因测序产业链研究报告.docx
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1、基因测序产业链研究报告一、基因测序产业链的基本概况基因是由一段DNA构成的具有一定功能的核昔酸序列,一部分基因用于指导蛋白质合成;还有一部分非编码DNA用于基因表达调节。DNA是一种生物大分子,在空间结构上呈双螺旋结构,由脱氧核糖和磷酸交替连接外列在外侧构成骨架,碱基排列在内侧,两条链上的碱基连接成碱基对。组成脱氧核糖核酸的碱基,分别是腺瞟吟(adenine,A)、胞喀咤(cytosine,C)、鸟瞟吟(guanine,G)与胸腺口密咤(thyminezT)o带有蛋白质编码的DNA片段称为基因(gene)o基因测序技术(DNASequencing),是指获得目标DNA片段碱基(包括腺瞟吟A、胸
2、腺嚓咤T、胞喀咤C与鸟瞟岭G)排列顺序的技术。在基础生物学研究,以及包括医学诊断、生物技术开发、法医生物学、系统生物学、微生物学等不断拓展的多个其他应用领域中,基因测序技术已成为极其重要的专业技术之一。现代基因测序技术已经能帮助科学家获得人类基因组以及其他许多动植物和微生物物种的完整DNA序列。截止到目前为止,基因测序技术已经发展出四代。对比四代测序技术,最早实现商业化应用的测序技术是一代测序,但基于Sanger原理的毛细管电泳测序仍是超高精度测序的金标准,因此该测序技术尚未完全被取代。二代测序具有通量高、成本低的特点,但读长短的缺点导致测序过程中含量较少的序列信息可能会丢失且PCR过程中有一
3、定概率会引入错配碱基;想要得到准确和长度较长的拼接结果,需要测序的覆盖率较高,导致结果错误较多和成本增加,但不妨碍二代测序技术成为现阶段商业化应用最为广泛的技术之一。三代和四代具有超长读长的特点,因此对二代测序是一个很好的补充,但成本及准确率原因,目前还未得到广泛使用。第一代测序技术:1977年,Wa1terGi1bert和FrederickSanger发明了第一代测序技术,并应用该测序技术测定了首个基因组序列:全长5375个碱基的噬菌体X174o双脱氧链终止法与化学降解法以及其衍生方法被统称为Sanger测序技术。Sanger测序技术在结合荧光标记和毛细管电泳后,在人类基因组计划中得到广泛的
4、应用,但是Sanger测序技术一次只能获得一条长度在700至Iooo个碱基的序列,已经无法满足现代科学发展对生物基因序列获取的迫切需求。第二代测序技术:高通量测序技术(High-throughputsequencing)是对传统Sanger测序技术的革命性改变,可一次对几百万到几十亿条核酸分子进行序列测定,部分文献资料亦称其为大规模并行测序(Massive1yPara11e1Sequencing,MPS)或下一代测序技术(NextGenerationSequencing,NGS)。目前,高通量测序技术包含三种主流方式:桥式PCR扩增与边合成边测序结合的测序技术、乳液PCR与半导体合成测序技术、
5、DNA纳米球与联合探针锚定聚合技术结合的测序技术。第三代测序技术:单分子测序技术以PacBio公司的SMRT单分子测序技术为代表,SMRT芯片是一种带有很多ZMW孔(零模波导孔)的厚度为WOnm的金属片,将DNA聚合酶、待测序列和不同荧光标记的dNTP放入ZMW孔的底部。每个ZWM孔只允许一条DNA模板进入,DNA模板进入后,DNA聚合酶与模板结合,加入4种不同颜色荧光标记4种dNTP,其通过布朗运动随机进入检测区域并与聚合酶结合从而延伸模板,与模板匹配的碱基生成化学键的时间远远长于其他碱基停留的时间,因此统计荧光信号存在时间的长短,可区分匹配的碱基与游离碱基。通过统计4种荧光信号与时间的关系
6、,即可测定DNA模板序列。第四代测序技术:纳米孔测序技术以OXfordNanoporeTechno1ogies为代表的纳米孔测序技术与其他测序技术不同的是,它基于电信号而不是光信号。将在某一面上含有一对电极的特殊脂质双分子层置于一个微孔之上,该双分子层中含有很多由造血素蛋白组成的纳米孔(直径2.6nm),只能容纳一个核甘酸通过,并且每个纳米孔会结合一个核酸外切酶。当DNA模板进入孔道时,孔道中的核酸外切酶会抓住DNA分子,顺序剪切掉穿过纳米孔道的DNA碱基,每一个碱基通过纳米孔时都会产生一个阻断,根据阻断电流的变化就能检测出相应碱基的种类,从而进行实时测序,最终得出DNA分子的序列。基因测序技
7、术的分类跚高禾投资研究中心H式PCR:广昌序姑合讪耳子=孔SPCR与合术第一代基因测序技术Sanger测序技术第二代基因测序技术高通测序技术DNA纳米球与联合网健定聚合技术结合测II第三代基因测序技术纳米孔as序DNA$行半第四代基因测序技术二.基因测序产业的市场规模空间近几年,各国政府持续加大对基因测序产业的扶持力度,先后推出了多项相关政策、规划等产业指导。基因测序产业在全世界都保持快速增长;欧洲和美洲贡献主要份额;下游应用端目前以学术研究应用为主,未来医院端市场具有巨大发展空间。基因测序行业已经形成比较成熟的产业链上中下游分工体系:基因测序产业链的上游是基因测序相关仪器、耗材及试剂供应商,
8、提供基因测序平台和解决方案。基因测序技术是基因测序仪的核心,在多种基因测序技术中,以I11Umina、ThermoFisher和发行人为代表的高通量测序技术是目前市场较为主流的测序技术。上游环节呈现典型的寡头垄断竞争格局。目前,二代测序仪仍然占据市场主流,而在2017年之后,借助于HiSeq系列测序仪升级和推广,I11umina不断蚕食其他厂商的市场份额,逐渐形成了一家独大的局面。2023年zI11umina的市场份额已增长至84%,稳居第一;1ifeTech和罗氏的市场份额也在5%以上,相对较大。根据MarketsandMarkets.灼识咨询数据,在应用场景不断拓宽,测序能力进一步加强的共
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