循环肿瘤DNA超深度测序在肺结节恶性评估的应用研究.docx

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1、循环肿瘤DNA超深度测序在肺结节恶性评估的应用研究黄冬云许文景【摘要】目的：针对当前循环肿瘤DNA超深度测序用于疑似肺结节恶性患者的效果开展深入分析，为疑似肺结节恶性患者的诊断以及后续治疗提升指明改进方向。方法：逗择我院2022年6月到2022年12月疑似肺结节恶性患者为研究对象，对其进行循环肿瘤DNA超深度测序以及金标准诊断，分析判断研究循环肿瘤DNA超深度测序在肺结节恶性评估的应用价值。结果：循环肿瘤DNA超深度测序诊断的灵敏度为92. 45%,特异度为50. 00%,准确度为90. 91%。结论:循环肿瘤DNA超深度测序可以为肺结节恶性患者的病情评估提供积极意义。【关键词】循环肿瘤DNA

2、超深度测序；诊断精准度；灵敏度；特异度;肺结节恶性纳排标准后，选择我院2022年6月到2022年12月55例疑似肺结节恶性患者为研究对象。患者：男性30例，女性25例；年龄为28-64岁，平均年龄(4545366)岁。1. 2方法首先采集疑似患者的静脉血液，然后抽提血浆游离DNA,并且用抽提好的DNA来构建文库。用捕获试剂盒来对文库进行杂交捕获。在这个Panel当中，包括按照hgl9参考基因组序列，设计目标区域。这些区域可以用于检测点突变、和插入缺失突变。同时，对于ALK和R0S1这两个基因中常见的、易发生融合基因突变的位点，也设计了相应的捕获探针，来更好地检测到融合基因突变。捕获完毕的文库用

3、高保真聚合酶进行扩增，然后对PCR扩增产物进行纯化。扩增好的文库，用HiSeq2000测序仪，进行读长100碱基的双端测序，这里要特别说明一下，ctDNA的测序是非常深的，一般情况下，会测到上万倍、甚至首先采集疑似患者的静脉血液，然后抽提血浆游离DNA,并且用抽提好的DNA来构建文库。用捕获试剂盒来对文库进行杂交捕获。在这个Panel当中，包括按照hgl9参考基因组序列，设计目标区域。这些区域可以用于检测点突变、和插入缺失突变。同时，对于ALK和R0S1这两个基因中常见的、易发生融合基因突变的位点，也设计了相应的捕获探针，来更好地检测到融合基因突变。捕获完毕的文库用高保真聚合酶进行扩增，然后对

4、PCR扩增产物进行纯化。扩增好的文库，用HiSeq2000测序仪，进行读长100碱基的双端测序，这里要特别说明一下，ctDNA的测序是非常深的，一般情况下，会测到上万倍、甚至首先采集疑似患者的静脉血液，然后抽提血浆游离DNA,并且用抽提好的DNA来构建文库。用捕获试剂盒来对文库进行杂交捕获。在这个Panel当中，包括按照hgl9参考基因组序列，设计目标区域。这些区域可以用于检测点突变、和插入缺失突变。同时，对于ALK和R0S1这两个基因中常见的、易发生融合基因突变的位点，也设计了相应的捕获探针，来更好地检测到融合基因突变。捕获完毕的文库用高保真聚合酶进行扩增，然后对PCR扩增产物进行纯化。扩增好的文库，用HiSeq2000测序仪，进行读长100碱基的双端测序，这里要特别说明一下，ctDNA的测序是非常深的，一般情况下，会测到上万倍、甚至